В ручную класть слои в шопе действительно муторно. Но не только в этом дело. Если складывать кадры с сильными шумами (а именно в этом случае усреднение и имеет смысл), то шум от первого кадра, на который кладутся остальные, будет виден даже после наложения десяти слоев, так как первый слой нельзя сделать полу прозранчым. Поэтому складывать нужно через HDR сборку. А так как в отличие от HDR тонмаппинга в нашем случае ничего крутить ненужно при сборке, то весь процесс заключается только в том чтобы указать HDR собиралке исходники и нажать ОК.