Если я правильно понял вопрос, то возможно поможет, сам пользуюсь таким методом. Удобно.
Итак, сделал рисунок, потом чтоб выровнять края жмешь Клипин Маск, получаем красивый квадратик и кучу невидимых линий. Я убираю так - не снимая выделения переходим в слои, открываем и блокируем слой Clipping Path он самый верхний. Появляюся не видимые объекты за пределами маски, после берем инструмент Eraser (Shift+E) и убираем лишнее. Используем горячие клавиши Shift - помогает провести ровную линию, и Alt выделяет прямоугольную область. Очень удобно ровнять квадрата ровные грани.
Надеюсь поможет.