Joint,
после сохранения файла и его закрытия отметить операции нельзя.
Зачем делаете слияние слоёв после всех операций? После перевода RAW в TIF делайте дубликат слоя и все следующие операции делайте только на дубликате слоя, сохраняя оригинальный слой нетронутым, Желательно переделать его в Smart Object, если потом делаете ресайз, например, и если размер TIF файла не волнует. Слияние слоёв не делайте.
16 бит переводить в 8 нужно для того, что бы было возможно сохранить в JPG.